Oddelenie subjadrovej fyziky sa orientuje na výskum v oblasti fyziky vysokých energií a aktývne sa zapája do zaujímavých experimentov, ktorí sa uskutoéšujá v najvýznamnejších urých’ovacóch strediských. Na zažiatku existencie oddelenia (do 1980) prevalovala spolupráca na experimentoch s bublinovými komorami na urých’ovaíoch JINR v Dubne a IHEP Protvino blízko Serpuchova v Ruskej federácii.
Od roku 1987 sa časí oddelenia zapojila do prípravy experimentu H1 na HERA v DESY (Hamburg, Nemecko). Bolo vyrobené vešká množstvo šítacích panelov pre kalorimeter s tekutóm argónom. Navrhli sme a neskór realizovali trigrovaciu elektroniku na identifikáciu elektrónov v zadnom elektromagnetickom kalorimetri.
Dlhodobá spolupráca s H1 experimentom na HERA je jednou z najdóležitejších súčasných aktivít oddelenia. Medzi dalšie súčasné aktivity patrí účasí na experimentálnom programe v Európskom Laboratóriu Casticovej Fyziky CERN (Zeneva, Svajčiarsko). Naším hlavným zameraním je oblast fyziky t’ažkých iónov na uróchýovaći SPS. Momentálne sa hlavne venujeme préprave programu LHC, kde sa venujeme rozvoju nových detektorov (plynový mikrostrápová komory, nový koncept argánového kalorimetra). V súčasnosti sú naše aktivity rozdelené medzi experimentami H1, ATLAS a ALICE.