A   Részecske- és Magfizikai Kutatóintézet főbb kutatási irányai:

Alapkutatáok a a nagyenergiájú részecske- és magfizika, az űrfizika, elméleti fizika és a biofizika területén.

Alkalmazott kutatósokkal és fejlesztősekkel foglalkozunk a lézer technika, a nukleáris analitika és az optikai valamint röntgen spektroszkópia területén is.

Kutatásaink jelentés része az u.n. "big science" ("nagy tudományok") témakörébe tartozik, ami azt jelenti, hogy ezeket nagy nemzetkézi kutatï központokkal szoros együttműködésben végezzék. Ezek közül a legjelentősebbek pl. a CERN (részecskefizika), a NASA (űrkutatások) és az EURATOM (termonukleáris reakciók).

Számos kutatunk oktatósi feladatokat is végez az orszög tébb egyetemén, pl. ELTE a BME és a Debreceni Egyetem. Az egyetemek diákjainak egy része a diploma és PhD fokozatuk megszerzéséhez nálunk végzik kutatásaikat.